<?php
if (!defined('APP_PATH')) {
	define('APP_PATH', $_SERVER['DOCUMENT_ROOT']."/bdACPA");
}
require_once(APP_PATH.'/required.php');
// require('../setup.inc.php');
// include('../auth.php');

//set content type and xml tag
header("Content-type:text/xml");
echo("<?xml version=\"1.0\" encoding=\"utf-8\"?>\n");

$out = "";
$out .=  "<items>";
$out .= "	<item type='settings' width='1200' position='label-top' inputWidth='180'/>";
$out .= "		<item type='newcolumn' offset='50'/>";
$out .= "	<item type='block' width='1200' >";
$out .= "			<item type='label' name='titrePuce' label=''/>";
$out .= "			<item type='hidden' name='idPuce' value=''/>";
$out .= "			<item type='hidden' name='idDossier' value=''/>";

//marque_puce
$out .= "			<item type='combo' name='typePrelevement' label='Type du prélèvement' inputWidth='400' validate='NotEmpty' readonly='1'>";
$prelevs = $TYPEPRELEVEMENT_DAO->rechercher_type_prelevement();
$out .= "				<option value='0' text='à définir'/>";
foreach ($prelevs as $prelev)
{
	$out .= "			<option value='".intval($prelev->idtypeprelevement)."' text='".remove_carspeciaux($prelev->libelle)."'/>";
}
$out .= "			</item>";

//marque_puce
$out .= "			<item type='combo' name='marquePuce' label='Marque de la puce' inputWidth='400' validate='NotEmpty' readonly='1'>";
$marques = $MARQUEPUCE_DAO->rechercher_marque_puce();
$out .= "				<option value='0' text='à définir'/>";
foreach ($marques as $marque)
{
	$out .= "			<option value='".intval($marque->idmarquepuce)."' text='".remove_carspeciaux($marque->libelle)."'/>";
}
$out .= "			</item>";


//type_puce
$out .= "			<item type='combo' name='typePuce' label='Model de puce' inputWidth='400' validate='NotEmpty' readonly='1'>";
$out .= "			</item>";

//analyse
$out .= "			<item type='combo' name='versionhg' label='Version du génome' inputWidth='200' validate='NotEmpty' readonly='1'>";
$out .= "				<option value='hg19' text='hg19'/>";
$out .= "				<option value='hg18' text='hg18'/>";
$out .= "			</item>";


//analyse
$out .= "			<item type='input' name='analyse' inputWidth='400' label='Analyse effectuée' tooltip='vous pouvez entrer l&#39;algorithme utilisé, le logiciel utilisé pour analyser la puce et tout autre commentaire sur l&#39;analyse' value='' rows='10'/>";

$out .= "		<item type='newcolumn' offset='200'/>";
$out .= "			<item type='label' name='titre2' label='.'/>";
//resolution
$out .= "			<item type='input' name='resolution' inputWidth='400' label='Résolution' tooltip='vous pouvez entrer la résolution moyenne de la puce utilisée' value=''/>";

//taille min
$out .= "			<item type='input' name='taillemin' inputWidth='400' label='Taille minimale des CNV (si vous vous êtes fixé un seuil d&#39;analyse)' tooltip='' value='' />";

//nbmqdeviants
$out .= "			<item type='input' name='nbmqdeviant' inputWidth='400' label='Nombre de marqueurs déviants minimal (pour qu&#39;un CNV soit détecté)' tooltip='' value='' />";


//qualité
$out .= "			<item type='input' name='qualite' inputWidth='400' label='Critères qualité de la puce' tooltips='vous pouvez entrer les valeur des critères qualités obtenu ainsi que tout autre commentaire sur la qualtié de la puce' value='' rows='10'/>";
$out .= "		</item>";
//formule chromosomique
$out .= "			<item type='input' name='formulechromosomique' inputWidth='1000' label='Formule chromosomique du résultat final (ICSN 2013)' tooltip='Entrer la formule chromosomique du patient (après vérfiaction)' value='' rows='8'/>";



//$out .= "</item>";
$out .= "</items>";
print($out);
?>